乳酸菌は炊くと死んでしまうと思いますが、効果はあるの？

あります。
乳酸菌は一般的に熱に弱く、炊飯すると死んでしまいます。
しかし、これが「死菌」としてエサとなるため、腸内の善玉菌を増やす材料となります。
乳酸菌の場合、死菌は生菌と同じような効果があることが知られています。